CVŘ jako provozovatel dvou výzkumných jaderných reaktorů a navazující infrastruktury je povinen zajišťovat na svých jaderných zařízeních a navazující infrastruktuře jadernou bezpečnost, technickou bezpečnost, fyzickou ochranu a radiační ochranu (dále bude zmiňována jen jaderná bezpečnost), a to dle příslušné legislativy – z. č. 263/2016 Sb., atomový zákon, a příslušná sekundární legislativa.
CVŘ si je v souladu se základními principy mírového využívání jaderné energie vědomo naprosté nadřazenosti jaderné bezpečnosti nad ostatními procesy a činnostmi a postupuje dle tohoto principu.
Oba reaktory i navazující infrastruktura jsou ve stavu a mají schopnosti požadované legislativou, kromě toho CVŘ provádí následující hodnocení bezpečnosti: periodické hodnocení bezpečnosti, průběžné hodnocení bezpečnosti, zvláštní hodnocení bezpečnosti před provedením změny, zvláštní hodnocení bezpečnosti v případě RMU nebo v případě RMU na jiném jaderném zařízení podobného typu, zvláštní hodnocení bezpečnosti při podezření na snížení úrovně JB, RO, TB, MRS, zvládání RMU a zabezpečení, deterministické hodnocení bezpečnosti, pravděpodobnostní hodnocení bezpečnosti, hodnocení kultury bezpečnosti, hodnocení lokality.
Plnění požadavků legislativy z pohledu jaderné bezpečnosti je deklarováno prostřednictvím bezpečnostní dokumentace, kde nejvýznamnější dokumenty jsou Provozní bezpečnostní zprávy, popisující kompletně projekty obou reaktorů z pohledu všech systémů, komponent a zařízení, včetně bezpečnostních hodnocení a bezpečnostních analýz a mnohého dalšího, či Limity a podmínky pro trvalý provoz reaktorů, stanovující podmínky provozu reaktoru, pro které je prokázáno, že provoz reaktoru je bezpečný, a současně stanovující činnost obsluhy reaktoru při nedodržení těchto podmínek.
Významným prvkem zajištění jaderné bezpečnosti je pravidelná a otevřená komunikace se Státním úřadem pro jadernou bezpečnost, spolupráce v oblasti jaderné bezpečnosti s dalšími výzkumnými organizacemi tuzemskými i zahraničními a s univerzitami a vysokými školami.